http://hispamed.blogalia.com/ Informática aplicada a las ciencias biomédicas. es-ES Copyright jbonis jbonis jbonis http://hispamed.blogalia.com//historias/11084 Hola a todos, después de muchísimos meses. <br><br> <br /> He decidido mudar esta "bitácora" a este lugar: <a href="http://www.juliobonis.com/portal/">www.juliobonis.com/portal/</a><br> <br /> <br> <br /> Las razones son varias, entre ellas que ahora que controlo mi servidor puedo hacer más cosillas, y además así libero un poco de peso de los servidores de blogalia, que tan amablemente RVR nos cede a los blogalitas. <br /> <br> <br /> Ahora solo me queda averiguar como puedo sindicar mi nueva dirección con blogalia.<br> <br /> ¡Nos vemos en nuestra nueva ubicación!<br> <br /> <br /> http://hispamed.blogalia.com//historias/2521 <A HREF="http://www.sjdm.org/~alansz/courses/mhpe494/">http://www.sjdm.org/~alansz/courses/mhpe494/</A>, ala, a disfrutarlo con salud. http://hispamed.blogalia.com//historias/2395 La medicina es un asunto de toma de decisiones. El personal sanitario toma decisiones constantemente (¿le mando una radiografía a este paciente que tiene una espina de pescado clavada en la garganta?, ¿le doy la dosis de recuerdo de la antitetánica a este paciente? ¿le doy tratamiento antibiótico a esta infección de vías respiratorias altas? ¿le mantengo a este paciente la respiración asistida? ¿informo a la familia? ¿le mando al especialista o a su casa?), los pacientes también toman muchísimas decisiones (¿voy al médico o no voy? ¿voy a urgencias o al centro de salud? ¿me tomo la pastilla que me han recetado o la tiro por el sumidero? ¿le oculto al médico esta información? ¿me opero la miopía con laser? ...). <br /> Sería interesante por tanto estudiar el proceso de toma de decisiones. Este no es sino un proceso psicológico en el que influyen bastantes factores. <br /> <br /> La idea central es que si conocemos como funciona el proceso de toma de decisiones, podremos tratar de encontrar los puntos donde este proceso puede ser mejorable, esto es los puntos donde se produce un error. <br /> <br /> Los errores médicos son una importante causa de muerte y enfermedad en los paises desarrollados (en los desarrollados no porque no tienen asistencia sanitaria en muchos casos y si no hay médico este no puede equivocarse). <br /> <br /> Conocer donde se produce el error y las causas de este error es el paso previo necesario antes de diseñar sistemas que traten de disminuir el error médico mediante el apoyo a la toma de decisiones. <br /> <br /> Si sabes alemán quizá te interese este documento de <a href="http://www.medizinische-kybernetik.de/methods/decis-theory/med-decis-theory.pdf">introducción a la toma de decisiones clínicas</a>. <br /> Un libro fundamental en este campo es "Thinking and deciding" de Jonathan Baron. <br /> Un concepto importante en el campo de la toma de decisiones en medicina es el de razonamiento heurístico. Una heurística es una regla, ayuda o información que nos facilita la búsqueda de una solución. http://hispamed.blogalia.com//historias/2203 Imaginemos que tenemos que programar un robot de 4 patas para que camine. <br /> <br /> Una opción es estudiar como debería mover las cuatro patas (primero la delantera izquierda avanza 45º y luego la trasera derecha avanza 30º.... y así). <br /> <br /> Pero ¿qué pasa si tenemos que programar robots de 4, 5, 6, 2 patas, cada uno con patas diferentes?. ¿y si resulta que le enseñamos a caminar sobre cesped pero luego cuando le ponemos sobre arena se atasca?. ¿y si queremos que aprenda a subir escaleras?. <br /> <br /> Una alternativa es utilizar algoritmos genéticos. Estos se basan en la ley de la selección natural y las mutaciones. <br /> <br /> Supongamos que generamos al azar dos combinaciones de movimientos. Es decir, el robot por sí solo empieza a mover las patas sin ton ni son con dos estrategias diferentes (generadas al azar). <br /> <br /> Luego decide cual de las dos es mejor (¿con cual avanzo mejor?) y la selecciona. Introduce entonces una pequeña variación (mutación) y la compara con la original.... ¿cual es mejor?... y así sucesivamente. <br /> <br /> Al final, teóricamente, debería seleccionarse la mejor combinación. El robot es capaz de aprender por sí solo mediante una estrategia de ensayo error. <br /> <br /> Más sobre algoritmos genéticos: <br /> <br /> <A HREF="http://directory.google.com/Top/Computers/Artificial_Intelligence/Genetic_Programming/">http://directory.google.com/Top/Computers/Artificial_Intelligence/Genetic_Programming/</A> http://hispamed.blogalia.com//historias/2148 Desde que en Abril entré a formar parte del Laboratorío de Informática Médica del <a href="http://www.imim.es/">IMIM </A> no he tenido practicamente tiempo para enviar mensajes a esta bitácora. <br /> <br /> Para lo que sí he tenido tiempo es para aprender, y mucho, con el proyecto al que estoy adscrito: <a href="http://www.smartie-ist.org/">SMARTIE</A> (Smart Medical Applications Repository of Tools for Informed Expert decision). <br /> <br /> El proyecto SMARTIE consiste en el desarrollo de herramientas de apoyo a la decisión clínica basados en computador. La idea fundamental del proyecto es que desarrollar un complejo sistema experto (por ejemplo el PNEUMONIA) es menos útil que disponer de miles de pequeñas herramientas de ayuda al diagnóstico puntuales. Esto entronca en cierto modo con la computación distribuida y la idea de los sistemas multiagente (tema en el que querría desarrollar próximas investigaciones y quien sabe si mi tesis doctoral). <br /> <br /> Un sistema experto hablando en plata es un sistema informático que puede resolver problemas como lo haría un experto. El desarrollo de sistemas expertos es algo muy complejo, por lo que el truco está en deliminar muy bien los límites del problema, para así poder controlar la mayor parte de los parámetros. Un ejemplo de sistema experto podría ser aquel que nos indica el mejor antibiótico a utilizar en una pneumonía adquirida en la comunidad (no nosocomial), como el caso de PNEUMONIA. Para el desarrollo de sistemas expertos se utilizan redes Bayesianas y lógica difusa. <br /> <br /> Un sistema experto es una herramienta de apoyo a la decisión (DST Decision Support Tool), muy compleja. Ahora imaginemos que tenemos cientos o miles de DST pequeñitas, circunscritas a problemas aún más concretos. Por ejemplo tenemos una calculadora del "índice de masa corporal" que nos ayuda a hacernos una idea de si una persona está obesa o desnutrida. Tenemos la escala de Ranson que nos ayuda a saber la gravedad y pronóstico de una pancreatitis no alcohólica. Y así sucesivamente. <br /> <br /> ¿Qué estrategia será mejor? Los sistemas expertos se han mostrado realmente útiles en entornos experimentales, pero no así en la práctica (diferencia entre eficacia y eficiencia). Las causas de la poca utilidad en entornos reales son múltiples, pero entre ellas destaca la escasa aceptación por parte del clínico. De nada sirve tener una herramienta de apoyo a la decisión si no se usa (por su complejidad de uso) o si los resultados de usarla no modifican la toma de decisiones posterior (lo cual ocurre cuando el clínico no se fía del sistema experto, entre otras cosas porque no es capaz de advertir como funciona por dentro). <br /> <br /> El proyecto SMARTIE pretende dotar al clínico de DSTs pequeñas pero de eficacia comprobada en entornos clínicos reales (validadas). Se pretende que estén disponibles en multiplataforma (PC, Internet, PDA). Es de esperar que así el médico tenga acceso a la herramienta en el momento en que la necesita. Además el objetivo es que la DST sea sencilla de utilizar y que el médico sea capaz de comprender su funcionamiento interno (con lo que confiará en los resultados de la DST). <br /> <br /> No es tarea fácil desde luego, pero sin duda apasionante. <br /> <br /> <br /> <br /> http://hispamed.blogalia.com//historias/1934 http://hispamed.blogalia.com//historias/1275 ., <br /> http://hispamed.blogalia.com//historias/1208 Con algo de retraso aquí tienen el resumen de mes de Abril de artículos publicados sobre informática médica. No son todos los que están, ni están todos los que son, pero son una buena muestra. <br /> <br /> Nada más y nada menos que 147 artículos, lo cual hace que estar al día empieze a ser algo difícil. <br /> <br /> De entre todos ellos he seleccionado los siguientes, que pueden leerse online: <br /> <br /> Estudio de factores de riesgo postural en usuarios de computadoras <a href="http://www3.interscience.wiley.com/cgi-bin/fulltext?ID=91016563&PLACEBO=IE.pdf">(1)</a> y <a href="http://www3.interscience.wiley.com/cgi-bin/fulltext?ID=91016561&PLACEBO=IE.pdf">(2)</a>. <br /> <br /> Modelo informático de la célula ductal del páncreas. <a href="http://www.joplink.net/prev/200107/200107_3.pdf">(1)</a> <br /> <br /> Hand-arm vibration syndrome may be associated with prolonged use of vibrating computer games. ¡Cuidado con la playstation! <a href="http://bmj.com/cgi/content/full/324/7332/301/a?view=full&pmid=11823380">(1)</a> <br /> <br /> Computer-Aided Measurement of Cell Shortening and Calcium <br /> Transients in Adult Cardiac Myocytes. <a href="http://pubs.acs.org/journals/bipret/article.cgi/bipret/2001/17/i05/pdf/bp010080q.pdf">Bricolaje celular</a> <br /> <br /> http://hispamed.blogalia.com//historias/1035 Si estás pensando en desarrollar un software para uso en medicina es interesante leer este documento de la FDA. <br /> <br /> http://www.fda.gov/cdrh/comp/guidance/938.html http://hispamed.blogalia.com//historias/874 Cuando los clínicos se ponen a desarrollar software, normalmente no conocen la "metodología". Normalmente piensan que "informática" = "computadoras", y se imaginan que los informáticos están todo el día tecleando código. <br /> <br /> Lo que no saben los clínicos (porque nadie les enseña) es que el desarrollo de software no es como hacer una cesárea, sino que se parece más a construir una casa. <br /> <br /> Hacer una cesárea es algo más o menos "automático". Se aplican unos parámetros y se decide: "hacemos cesárea". A partir de ahí, salvo complicaciones raras, es todo bastante mecánico: 1) corto por aquí, 2) coso por allá. <br /> <br /> Los ingenieros informáticos (si son verdaderos profesinoales) dedican un 60-70% a trabajar con papel y lapiz y un 30% a "teclear en el computador". Primero hacen los planos y luego construir la casa es algo "sencillo" (como hacer la cesárea). <br /> <br /> Pero los informáticos en el campo biomédico se encuentran con un problema: "no conocen el terreno". Saben que tienen que hacer planos, pero no saben como tienen que ser esos planos, ni si la casa tiene que tener ventanas, así que construyen software (casas) que luego los inquilinos (usuarios) encuentran incómodas. <br /> <br /> Los médicos saben como les gustaría que fuera su casa (software) pero no saben hacer planos. Así que cuando se proponen hacer una casa se ponen directamente a levantar muros, pero en cuanto el muro alcanza un poco de altura la casa se derrumba. Cuando no se derrumba (con mucha suerte) el problema es que la casa (programa) al final tiene las paredes torcidas y no se parece a lo que habían imaginado. <br /> <br /> ¿Soluciones?